Рибозим типа hammerhead

Вторичная структура фрагмента RZ+ рибозима NC_003540.

Трехмерная структура полного рибозима типа Hammerhead, выделенный из вида Schistosoma mansoni ^[1]

Рибозимы типа hammerhead — это малые саморазрезающие РНК, которые имеют консервативную последовательность и обнаружены у некоторых вироидов и ассоциированы с сателлитными РНК некоторых вирусов растений.^[2]

Впервые рибозимы типа hammerhead были открыты у вириоидов растений, такие рибозимы катализировали сиквенс-специфичное разрезание фосфо-диэфирных связей в молекулах РНК благодаря специфической третичной структуре.^[3][4] Вторичная структура напоминает головку молотка — англ. hammerhead.

Саморепликация

Данный рибозим способен самореплицироваться. Репликация происходит по типу катящегося колеса^[5]. РНК надрезается в точке начала катящегося кольца. К освободившемуся 3' концу этой цепи начинают пристраиваться свободные дезоксинуклеотиды. По мере удлинения дочерней цепи РНК 5' конец из материнского кольца вытесняется. Когда 3' и 5' концы встретятся в одной точке, синтез РНК прекращается и дочернее кольцо отделяется от материнского.

Ссылки

• Вторичная структура рибозима Hammerhead  (рус.). Virtual Laboratory Wiki. — (изображения). Архивировано из первоисточника 19 марта 2012. Проверено 2009-15-10.

• О незначимости энергетической оценки при моделировании РНК - исследование в Викиверситете, по моделированию третичной структуры на примере рибозима типа hammerhead

См. также

• Рибозим, содержащий шпильку
• Точка начала репликации
• Сплайсинг

Примечания

1. ↑ Martick M, Scott WG (2006). «Tertiary contacts distant from the active site prime a ribozyme for catalysis». Cell 126 (2): 309–320. DOI:10.1016/j.cell.2006.06.036. PMID 16859740.
2. ↑ Forster AC, Symons RH (1987). «Self-cleavage of plus and minus RNAs of a virusoid and a structural model for the active sites». Cell 49 (2): 211-220.
3. ↑ Prody GA, Bakos JT, Buzayan JM, Schneider IR, Bruening G (1986). «Autolytic Processing of Dimeric Plant Virus Satellite RNA». Science 231 (4745): 1577–1580. DOI:10.1126/science.231.4745.1577.
4. ↑ Hutchins CJ, Rathjen PD, Forster AC, Symons RH (1986). «Self-cleavage of plus and minus RNA transcripts of avocado sunblotch viroid». Nucleic Acids Res. 14 (9): 3627-3640.
5. ↑ Flores R, Navarro JA, de la Peña M, Navarro B, Ambrós S, Vera A. Viroids with hammerhead ribozymes: some unique structural and functional aspects with respect to other members of the group. // Biol. Chem.. — 1999. — Т. 380. — № 7-8. — С. 849-854.